上海二本最好的专业包括：

上海电力大学的电气工程及其自动化专业：

该专业力压一众一本院校，由于行业特色鲜明，与电力企业携手推出“定制化培养”，最大限度确保毕业即就业。分数线通常高出特控线十几分。

上海应用技术大学的香精香料和化妆品专业：

这两个专业是该校的强势专业，对于色盲色弱嗅觉迟钝的考生不予录取，专业学习对化学基础要求较高。

立信会计金融学院的会计学和金融学：

这两个专业是国家级特色专业，审计学实力也相当不错，就业状况在上海也很不错，远超很多双非一本的财经专业。

上海健康医学院的订单定向培养专业：

重点为郊区培养全科医师，提前批的订单定向培养非常火爆。

上海工程技术大学的交通运输、车辆管理和工商管理专业：

这三个专业的录取分数线较高，需要在二本分数线以上几十分，就业率也很高，维持在98%左右。

上海电力大学的电气工程和新能源工程专业：

这两个专业不仅在上海区域内，在全国范围内都有较高的社会认可度，录取分数线较高。

上海政法学院的政法和监狱学专业：

这两个专业在外都有较高的业内认可度，学校被称为法律人才培养基地。

上海第二工业大学的机械工程及自动化、软件工程、物流管理专业：

这三个专业是国家级特色专业，整体就业情况和收入水平都不错。

上海商学院的商科专业：

包括园林、电子商务、金融学、会计学、信息管理与信息系统、税收学、法学、英语、财务管理和广告学等，这些专业认可度较高。

建议根据个人兴趣和职业规划，选择最适合自己的专业。同时，考虑到各专业的录取分数线和就业情况，上海电力大学、上海应用技术大学、立信会计金融学院、上海健康医学院、上海工程技术大学、上海政法学院和上海第二工业大学的专业都是值得考虑的。