审计工程合同时，应重点关注以下几个方面：

工程范围和内容条款

明确工程的具体范围，包括建筑物、构筑物的位置、规模、结构形式等。

检查工程内容的描述是否准确、完整，是否包括了附属工程、配套工程等。

工期条款

确定合同工期的起始日期和竣工日期，以及是否有分段工期要求。

检查工期延误和提前竣工的奖惩条款是否合理、明确。

质量条款

明确工程质量标准，是按照国家标准、行业标准还是合同约定的特殊标准执行。

检查质量验收的程序和方法是否详细规定，包括验收的主体、时间、内容等。

价款及支付条款

审查工程价款的计算方式，是固定总价、固定单价还是可调价格。

检查工程款的支付方式和支付节点，如是否按照工程进度支付，预付款、进度款、竣工结算款的支付比例和时间等。

材料设备供应条款

明确材料设备的供应方是发包方还是承包方。

合同双方当事人

关注发包人是否为现有的机关事业单位，还是为实施该项目成立的项目法人单位。

关注承包人是否为中标人或者是否为中标人的分公司等，是否存在利益关联方的问题线索。

工程概况

关注工程建设地点、建设规模和建设内容等是否与经批准的内容一致。

关注资金来源的构成及利息资本化情况。

关注工程承包范围，重点关注是否存在甲供材，并对甲供材的采购情况进行进一步审查。

合同主要日期

合同签订日期、工程开工日期及竣工日期等是否明确。

其他相关条款

审查合同是否明确规定勘察设计的基础资料、设计文件及其提供期限。

审查合同是否明确规定勘察设计的工作范围、进度、质量和勘察设计成果文件份数。

审查勘察设计费的计费依据、收费标准及支付方式是否符合有关规定。

审查合同是否明确规定双方的权利和义务，以及激励条款和违约责任追究条款。

通过以上几个方面的详细审查，可以确保工程合同的合法性、规范性和效益性，从而保障工程项目的顺利进行和资金安全。