在账目不全的情况下进行审计，可以采取以下步骤：

收集所有相关账目资料

包括合同、收据、银行流水等所有能证明交易真实性的文件。

整理账目

按照时间顺序排列账目，确保每笔交易都有明确的记录和对应的凭证。

核对账目一致性

核对每项支出和收入，检查账目之间的一致性，发现差异及时与相关人员沟通并查找原因。

沟通与查找原因

对于账目不全或差异，积极与合伙人或相关人员进行沟通，查找原因并制定解决方案。

制定清晰的账目管理制度

通过制定和实施有效的账目管理制度，确保未来账目记录的准确性和完整性。

利用第三方审计机构

如果账目不全情况严重，可以借助第三方审计机构进行专业审计，以获得更公正和客观的结果。

司法审计

在合伙人之间出现纷争且账目不清时，司法部门可能会启动审计程序，审计结果将作为裁决的重要依据。

持续监控和改进

定期对账目进行审计和检查，及时发现和纠正问题，确保账目管理的持续改进。

通过以上步骤，可以在账目不全的情况下进行有效的审计，确保财务信息的准确性和可靠性。