低估收入的审计方法主要包括以下几个方面：

深入了解被审计单位基本情况

宏观经济环境：了解国民经济的景气程度、利率、汇率、财政、货币、税收和贸易政策等。

行业情况：研究市场供求与竞争状况、经营的周期性或季节性、产品生产技术的变化、行业政策法规和会计惯例等。

企业内部情况：掌握主营业务情况、经营管理情况、财务状况、会计报表编报环境、纳税信用等级、执行的主要会计政策和适用的法律法规等。

调查了解内部控制情况

审阅内部控制制度：检查内部控制过程中生成的凭证和记录。

询问管理人员和其他有关人员：了解收入循环的实际运行情况。

观察收入循环的实际运行情况：进行穿行测试。

查阅以前年度的审计档案：评估内部控制的可信程度和薄弱环节，确定主营业务收入实质性测试的范围、内容和数量。

进行分析性复核

对主营业务收入进行分析性复核，同时也要对存货、主营业务成本等相关项目进行分析性复核。

通过对比实际产量和理论产量，检查是否存在将产品从“后门”销售转入“小金库”的可能。

依据会计资料中的上期主要产品的销售收入和销售数量，确定上期主要产品的平均销售价格，然后乘以本期销售量，计算出本期销售收入，并与本期账面销售收入进行对比，查找差异。

实物查出法

对被审单位能见的实物通过实地勘察，然后与账面核实。

检查有无闲置固定资产，尤其是闲置的可出租的房屋和可进行对外加工、作业的机器设备，以及下脚料、副产品的管理、销售等情况。

实物收付核对及实物盘点法

检查实际收付记录，加上实地盘点存货，找出破绽。

适用于货物存量少的单位，对于货物存量大的单位，可以先对材料、产成品会计及仓库保管员所管理的材料、成品等物资的出入库账册所记载的收（入库）进行核对。

截止期测试

把握与销售收入有密切联系的三个日期：销售发票开具日期、存货发出日期和记账日期，防止企业高估或低估收入。

通过以上方法，审计人员可以全面评估被审计单位是否存在低估收入的情况，并据此提出相应的审计意见和建议。