医保交给税务局的原因主要有以下几点：

整合管理

之前的农村新农合和城镇居民医疗保险由不同部门管理，征收费用的方式也不相同，这导致管理上存在不便和重复参保的现象。整合后，统一由税务部门征收，可以避免部门间的资源浪费和管理上的混乱。

便民服务

统一征收医保费用可以简化流程，减少参保人需要面对的多个部门，提高缴费效率，从而提升民众的满意度和便利性。

统一征收

整合后的城乡居民医疗保险采用统一的征收标准和方法，每个人只能以身份证号或社保号作为唯一参保缴费的识别码，有效防止了重复参保和重复缴费的问题。

公平公正

统一征收有助于确保每位参保人按照其应缴金额缴费，避免了因部门差异导致的缴费不公和财政资源的浪费。

加强税费管理

按照加强税费管理、强化征缴手段、节约行政成本、优化职能配置的要求，将社保费交由税务局征收，有助于提高征收效率和管理水平。

综上所述，医保交给税务局是为了更好地整合管理资源、提高征收效率、确保公平公正以及加强税费管理。