工程审计在审核财务时，应当注意以下几个方面：

合同金额的准确性与合理性

核实合同约定的总金额，包括所有费用项，确保无遗漏或错误。

进行横向分析，对比行业标准和市场工程造价信息，评估合同金额的合理性。

明确履约合同的支付条件

审核合同中关于付款时间、方式、节点的约定是否清晰。

检查项目进度款支付比例的合规性。

变更订单的处理约定

确保合同中有明确的变更处理流程，包括变更申请、批准及费用调整的具体条款。

违约责任与赔偿机制

认真审核违约金、滞纳金等补偿条款和限额的合理性。

结算与审计

确保合同中有清晰的结算流程和方法，包括最终账目的确认、发票的开具和支付完成。

此外，财务审计的工作流程通常包括：

接受业务委托，与客户就审计约定条款达成一致意见。

计划审计工作，制定科学、合理的审计计划。

识别和评估重大错报风险，实施风险评估程序。

应对重大错报风险，实施进一步的审计程序。

编制审计报告，形成适当的审计意见并出具相关报告。

在实际操作中，可以根据工程的具体情况选择合适的审计方法，如全面审计法或标准图审计法，以确保审计工作的有效性和效率。