会计报表的审计程序通常包括以下几个阶段：

制定审计计划阶段

调查了解被审计单位的基本情况：对被审计单位的经营情况、组织结构和管理当局进行了解。

签订业务约定书：明确约定双方的责任和义务，增进会计师事务所与委托人之间的了解。

执行分析性复核程序：帮助注册会计师确定其他审计程序的性质、时间和范围。

确定重要性：在编制审计计划时，注册会计师应当对重要性水平作出初步判断，以确定所需审计证据的数量。

评估审计风险：控制各账户余额的审计风险，以便在审计结束时将对会计报表整体发表意见的审计风险保持在适当水平。

编制审计计划：包括编制总体审计计划和具体审计计划。

实施审计工作阶段

内部控制进行符合性测试：测试被审计单位业务活动的运行与相关内部控制制度的符合程度。

收集审计证据：通过询问、审核、观察、函证、监盘等多种方法，评估财务报表的准确性和合规性。

实施审计测试：包括符合性测试和实质性测试，实质性测试包括检查、监盘、观察、查询及函证、计算、分析性复核等方法，对被审计单位会计报表项目金额进行的证实性测试。

审核关联交易：关注期后事项和或有损失，评估被审计单位持续经营能力。

提出调整会计报表的建议：对于在审计过程中发现的不符合会计准则及相关会计法规，需要调整会计报表的重大事项，以书面形式提出调整建议。

处理未调整事项：被审计单位未采纳调整建议时，注册会计师会对未接受调整事项进行整理，并作出书面记录，并根据未调整事项的性质和重要程度，确定是否在审计报告中予以反映，以及如何反映。

作出审计总结：根据获取的审计证据撰写审计总结，概括地说明审计计划的执行情况以及审计目标是否实现。

索取管理当局的声明书：获取管理当局对会计报表的声明。

结束审计工作阶段

审计期后事项和或有事项：关注审计期后发生的事项和或有事项，评估其对会计报表的影响。

取得管理当局声明书和律师声明书：获取管理当局和律师对会计报表的声明，确保会计报表的可靠性。

出具审计报告阶段

总体性复核：对会计报表实施总体性复核，确保审计证据的充分性和适当性。

形成审计意见：根据核实的审计证据，按照《独立审计具体准则》的要求，形成审计意见，包括无保留意见、有保留意见或否定意见。

编制审计报告：最终出具审计报告，客观、公正地反映审计结果，并提出改进建议。

以上是会计报表审计程序的详细步骤，每个阶段都需要注册会计师进行细致的工作，以确保审计质量。