要做好工程跟踪审计，可以从以下几个方面入手：

准备阶段

成立审计组，制定审计计划和实施方案，确定跟踪审计工作重点，收集审计资料，开展审前业务培训。

对拟进行跟踪审计的建设工程项目进行审前调查，印发审计通知书，进驻审计现场。

实施阶段

审计组应深入建设工程施工现场掌握实际情况，列席重要工程例会，了解工程进展的质量、进度、造价等情况。

审计组应实施访谈、测试、审核、查阅等必要的审计程序，审核与跟踪审计项目相关的过程文件资料，出具跟踪审计书面意见。

报告阶段

出具审计报告。审计组应依据跟踪审计进度撰写跟踪审计日志，并出具阶段性审计报告，报告的编制应当以经过核实的审计证据为依据，做到客观、公正、完整、清晰，具有建设性并体现重要性原则。

依据跟踪审计情况出具审计整改通知书或项目管理建议书。

审计内容

设计概算的审计：审查施工图纸的经济性和适用性，概算编制的依据是否充分，概算组成内容是否完整，概算是否符合可行性研究的批复要求，概算编制的内容是否符合法规、规范、政策等的要求。

工程量清单和招标控制价的审计：工程量清单编制依据的正确性，计算工程量前是否进行了必要的现场踏勘，取得了必要的踏勘记录，地勘报告及设计施工图是否经过审定，计算标准是否符合行业规范，编制要求是否有书面依据。招标控制价编制依据的正确性，适用的设计文件、技术标准、委托要求等。

施工合同规范情况

工程施工合同是承包人与发包人为完成商定的建设工程而明确相互权利、义务关系的书面协议，是工程建设质量、进度控制、投资控制的主要依据。跟踪审计人员应重点关注施工合同条款是否合法、合理、全面、有效，包括合同签订的方式、时间等是否合规，合同条款是否与招标文件响应一致，中标单位的投标承诺是否得以体现，工程质量、工程进度的要求是否明确，工期、质量、安全等方面的违约责任和奖惩措施是否明确，工程款的结算方式、支付方式是否明确，及有专业工程分包的限制等问题。

施工图纸准确情况

施工图纸是承包人施工的标准和依据，理论上所有的施工内容都要按图纸进行。跟踪审计人员应重点关注施工图纸是否完整、规范、准确，包括施工图纸设计说明内容是否完整，技术要求是否明确，图纸的平面尺寸、标高、坐标等是否准确，设备材料的名称、规格型号、数量是否标注准确，建施图与结施图的定位轴线和轴号是否一致，主要结构部位的位置、尺寸、做法是否明确，关键节点部位是否有节点详图，立面图、剖面图的代号、标注是否齐全，需要特殊的施工方法、施工机具的部位要求等。

跟踪审计常用的方法

审查资料的方法：包括审阅法、计算法、复核法和统计分析法，详细审查法和重点抽查法，顺查法和逆查法。审阅法的目的是通过对这些送审资料的阅读，熟悉工程情况，掌握审计标准，确定审计重点和获取有效审计证据。

检查实物的方法：通过实地检查施工现场，了解工程进展和实际完成情况。

审计调查的方法：通过访谈、询问等方式，了解工程相关人员的意见和看法，获取第一手资料。

通过以上步骤和方法，可以有效提高工程跟踪审计的质量和效率，确保工程项目的顺利进行和合规性。