毕业生留学档案的存放有以下几种选择：

学校存档：

部分高校提供档案留校保存服务，通常可保存1-2年，有的学校免费，有的需要支付保管费。优点是安全且手续简单，缺点是档案到期后若没有机构接收，档案可能会退还给原籍，存在丢失风险。

户籍所在地人力资源公共服务机构：

如人才服务中心、人力资源公共服务中心等。优点是留学期间档案和户口在同一地方，方便办理手续，安全性高。

教育部留学服务中心：

提供专门的留学生人事档案管理和相关延伸服务。优点是安全便捷，可以线上申请和审理，不需要本人来回跑。

非户籍就业地流动人员人事档案管理服务机构：

除超大城市外，在非公单位就业的高校毕业生的人事档案可存放在户籍地或就业地的流动人员人事档案管理服务机构。

选择存档方式时，应考虑个人情况和留学计划，并咨询相关机构了解具体的存档流程和规定。需要注意的是，档案不应由个人保管，以免影响其有效性和安全性