解决工程审计的问题可以从以下几个方面入手：

审计前的准备

管理关口前移：在审计计划阶段和审计实施初期就介入，提前策划，了解信息，和相关人员充分沟通。

明确审计范围和重点：认真研究上级审计的通知和要求，确保单位全体相关人员清楚了解审计的目标和任务。

明确应对机制：分工明确，对审计提出的问题有明确的责任人，确保回答审计提问时有理有据。

资料准备：全面梳理工程项目相关的文件资料，包括合同、预算、招投标文件、变更审批文件、验收报告、财务凭证等，确保资料的完整性和准确性。

自查自纠：对工程项目进行内部自查，及时整改发现的问题，主动解决潜在的风险点。

审计过程中的配合

安排专人对接：指定专门的联络人员，负责与审计组进行沟通协调，及时提供所需的资料和信息，解答审计人员的疑问。

态度诚恳：在审计过程中，保持积极主动的态度，诚恳接受审计人员的意见和建议，如实说明情况，并提出合理的解决方案。

审计后的整改

通知整改：若发现错误或不当之处，应立即通知相关责任单位或个人，明确指出错误所在，并要求其进行整改，详细记录错误内容、发生原因、责任单位或个人等信息，以备后续跟进和追责。

依法处理：对于涉及财务、合同等关键领域的错误，应严格按照相关法律法规和规章制度进行处理，如财务违规问题，应依据《会计法》等相关法律，对责任单位或个人进行处罚，并追回损失。

加强内部管理和制度建设：完善审计程序和流程，确保审计工作的准确性和公正性，加强审计人员的培训和教育，提高其业务素质和职业道德水平。

建立审计结果反馈机制：及时将审计结果和整改情况向相关部门和领导汇报，促进问题的及时解决和改进。

管理审计过程监督

关注内部控制体系：审查相关制度和流程，评估其是否能够有效防范风险，确保工程项目的顺利进行。

关注项目实施情况：通过现场检查、资料审查等方式，了解工程项目的实际情况，发现潜在的问题和风险，并提出相应的改进建议。

关注管理团队和人员素质：审查人员的资质、经验和业绩等，评估其是否能够胜任工程项目的管理工作。

提高审计质量和效率

审计内容全面：将工程审计与财务审计有机结合，同步对比项目建设进度与资金流动、完成节点与资金拨付等关键节点，验证工程建设、造价、财务的同一事件发生对应关系一致性。

协同组织高效：在审计中将工程审计与财务审计结合，同步进行，充分发挥各专业自身优势，相互对比增加问题线索的发现渠道方式，多角度多专业分析，找到解决问题的方案。

通过以上措施，可以有效解决工程审计中的问题，提高审计工作的质量与效率，确保工程项目的顺利进行和高效管理。