审计发现问题的方法多种多样，以下是一些常用的方法：

重视审前调查工作

在实施审计前，对被审计单位的工作职能、财务管理体制、内控制度、人员、机构及所属单位等基本情况有深入了解，有助于把握审计重点，发现潜在的重大违规违纪问题线索。

从内部控制的薄弱环节入手

对于内部管理薄弱、未建立完善的内部控制制度的单位，通过审阅凭证记录、调查询问和实物盘点等方式，可以发现固定资产、账实不符等问题，揭露管理混乱和国有资产流失等隐患。

运用分析性测试方法确定审计重点

通过分析财务报表、账簿、凭证等资料，确定审计重点，有针对性地进行审计。

风险预判

识别和评估组织可能面临的战略风险、运营风险、财务风险、市场风险和法律风险，起到预警作用。

不合规检查

检查是否符合法律、行业要求、企业制度要求以及内控18项等内容，找出不符合要求的问题。

对企业运营有影响的审计

识别和查找对企业经营效率、效益、效果有负面影响的问题。

深入了解业务和流程

对企业的业务流程、行业背景和现状进行深入了解，从细节中发现高质量的问题。

文档审查

审查企业的年报、战略规划和计划、市场分析报告、会议纪要等文档，获取企业总体战略和市场定位的清晰认识。

市场调研和竞争对手分析

通过参与行业研讨会、训练课程或展会，与行业专家交流，了解市场现状和竞争态势，分析主要竞争对手的优势和劣势。

从异常时间、地点和数字中发现问题

关注经济业务发生的特定时间、时间长短、距离的远近、商品流向以及数字值的大小和正负方向，发现异常情况并进行进一步核查。

审计调查方法

包括观察法、查询法、函证法和专题审计调查法，通过实地观察、口头或书面询问、发函了解情况以及针对特定专题进行深入调查，获取审计证据。

通过综合运用这些方法，审计人员可以更有效地发现被审计单位存在的问题，提高审计质量和效果。