应用审计信息系统可以通过以下几个步骤进行：

选择合适的审计信息系统

根据审计需求和实际情况选择合适的审计信息系统，如现场审计实施系统、通用审计软件、漏洞扫描软件等。

考虑系统的集成性、安全性和易用性，确保系统能够满足审计工作的需求。

系统描述与风险评估

在信息系统审计准备阶段，利用系统描述方法与工具对被审计单位业务流程、信息系统的结构、数据流程进行描述。

采用文字描述法、表格描述法、图形描述法及控制矩阵描述等方法，其中流程图工具软件是最常用的实务方法。

通过风险分析工具设定期望审计风险、评估重大错报风险并确定检查风险。

数据提取与处理

通过信息系统自动采集财务数据，提高数据准确性和效率。

对采集到的财务数据进行清洗、转换、整合，为审计提供数据支持。

审计实施

使用审计软件进行审计，如审计大师等，按照软件的使用步骤进行操作。

通过审计软件进行数据提取、报表生成、底稿和凭证输入、抽查等，提高审计效率。

结果分析与报告

对审计结果进行分析，形成疑点数据并进行二次处理。

自动生成审定报告，提供详细的审计结果和结论。

持续监控与改进

定期对审计信息系统进行维护和更新，确保系统的稳定性和安全性。

根据审计实践中发现的问题，对系统进行改进和优化，提高审计工作的质量和效率。

通过以上步骤，可以有效应用审计信息系统，提高审计工作的效率和质量，确保审计工作的规范性和准确性。