种业公司在进行无形资产评估时，主要采用以下几种方法：

市场法

市场法是基于相似公司或行业的市场交易价格来确定无形资产的价值。评估师会寻找与被评估企业相似的其他企业，并分析它们的市值和交易价格，通过比较相似企业的市场定价，得出无形资产的合理价值范围。这种方法适用于市场交易活跃、可比对象易于找到的无形资产，如商标、专利等。

收益法

收益法是根据无形资产预期未来现金流的经济效益来评估其价值。评估师会使用贴现率来计算出未来现金流的现值，并根据市场竞争和前景预测将其转化为可能的收益。收益法的关键在于确定适当的折现率或资本化率。这种方法适用于能够产生稳定现金流的无形资产，如商誉、特许经营权等。

成本法

成本法是计算替代或重建某类无形资产所需的成本。评估师会考虑无形资产的原始成本、改造成本和维护成本，以及在特定时期内的折旧和摊销情况。这种方法适用于那些能被替代或重建的无形资产，如某些专有技术或软件。

在实际操作中，评估师需要根据具体情况选择合适的评估方法，并确保评估结果的准确性和可靠性。此外，评估过程中还需要注意以下几点：

明确评估目的：在进行无形资产评估前，需要明确评估的目的，以确保评估结果符合企业的实际需求。

确认无形资产：确认无形资产的存在及其合法性，确保评估对象符合相关法律规定。

搜集资料：收集与无形资产相关的所有资料，包括市场交易数据、财务报表、技术文档等。

确定方法：根据无形资产的特性和评估目的，选择合适的评估方法。

做出结论：根据评估结果，得出无形资产的合理价值，并撰写评估报告。

撰写报告：将评估过程和结果整理成报告，供企业和其他相关方参考。

建议在种业公司进行无形资产评估时，选择具有专业资质和丰富经验的评估机构，以确保评估结果的客观性和公正性。