小金库的审计可以通过以下方法进行：

银行账户追踪法

要求被审计单位提供所有银行账户信息。

检查是否存在未提供的账户，追踪可能的账外账户。

单据查对法

审查单位收费单据，检查内部控制是否健全有效。

通过统计抽样法检查存根联是否全部入账。

核查支出凭据，如大额发票是否有合理的采购清单和收货记录。

分析判断法

对财务出入和业务活动资料进行仔细比较分析，确定小金库的存在可能性。

收入对比法

审查收入是否有规律性，对比过去三年的收入变化，发现异常。

支出排除法

排除正常支出项目和金额，重点审计不正常的费用。

账内与账外相结合

审阅账目和凭证，同时搜集账本以外的线索，如观察、询问和分析。

突击盘点

对库存现金和银行存款进行突击检查，发现资金挪用情况。

账户入手查源头

从审计银行账户入手，查清资金运动情况。

检查收据使用情况

审查收据登记制度的健全情况，确认收入是否全部入账。

检查往来科目

通过往来科目如“暂存款”隐匿收支，检查资金来源和用途。

询问外部人员

向被审计单位以外的相关人员询问，获取账外账的线索。

延伸审计

根据审计中发现的线索，进行延伸审计，查清问题。

检查支出凭证

仔细辨别支出凭证的真伪，检查是否有伪造等问题。

以上方法可以单独使用，也可以结合使用，以适应不同的情况和需求。审计过程中应保持灵活，根据实际情况调整审计策略和重点