要做好工程审计，可以从以下几个方面入手：

明确审计类型

确定是概算评审、预算评审、控制价评审还是结算评审，确保审计工作有的放矢，避免因类型混淆导致重大失误。

仔细查看合同

深入研究合同内容，包括合同类型、专用条款等，以明确审计的大方向和工作重点，防止因合同理解错误而影响审计结果。

认真核对资料

仔细检查施工方提供的预算、签证、洽商等资料，确保资料的真实性和完整性，通过资料间的对比发现可能存在的漏洞。

实地勘测现场

对项目现场进行实际测量和计量，确保工程量据实计入，避免因现场测量不准确而导致预算偏差。

合理调整预算

根据实际测量结果和计算规则，有根据地调整预算，力求达到接近完美的审计效果。

出具严谨结果

审计结果必须严谨，非经特殊要求不得随意调整预算，确保审计结果的权威性和可靠性。

关注项目支付流程

选定疑点项目，从中标情况和资金支付入手，核查工程付款情况，关注是否存在违法转分包和违规支付等问题。

以项目文书为依托

审查招投标过程，确保招投标活动的合法性和合规性，防止因违规操作导致审计风险。

加强现场跟踪

在项目现场设立办公场所，定期参加被审计单位的重要例会，及时了解项目进展情况，提出审计意见，并做好记录。

提高审计人员素质

加强工程造价审计人员的业务学习和培训，提高其专业知识和协调能力，以适应新形势下的审计工作需要。

综合运用多种审计方法

结合传统的审计方法和现代的审计方法，宏观和微观相结合，提高审计的效率和准确性。

通过以上措施，可以有效提升工程审计的质量和效率，确保审计结果的准确性和可靠性。