香港公司申请审计的流程如下：

准备审计资料

公司注册文件（如公司注册证书、商业登记证等）

公司的银行账单（所有公司账户的完整月结单）

业务相关单据（如合同、发票、收据等）

公司的运营开支（如租金、工资、水电费、物业费等）

上一年度的审计报告（如果不是第一次审计）

做账

公司提交原始凭证

持牌核数师理账后编制公司年度财务报表

提交审计报告

在接到香港税局传出的净收益税纳税申报表后，向香港税局递交香港执牌会计师出示的财务审计报告（全本阅读）及其填好结束的纳税申报表。

建议：

提前准备好所有需要的文件和记录，确保资料的完整性和准确性。

选择有资质的持牌核数师进行审计，以确保审计报告的合法性和专业性。

留意审计和纳税申报的时间要求，确保按时提交所有文件，避免延误。