工程审计的单价确定通常有以下几种方法：

按报审造价的一定比例计算

例如，千分之三或百分之四。

按核减造价计算

例如，核减金额的4-9%。

基本收费+追加收费

基本收费一般定为建设单位送审总造价的0.1-0.3%左右。

追加收费一般定为中价机构审减金额的4-9%左右。

综合因素考虑

工程规模和复杂程度。

审计时间和工作量。

审计机构和专业人员的费率。

其他额外费用，例如出差费用、材料费、技术设备费等。

建议

明确审计范围和要求：在与审计部门协商时，应明确工程的具体范围和要求，以便更准确地估算审计费用。

考虑市场行情：审计费用的市场行情也会影响最终确定的单价，可以咨询多家审计机构，了解当前的市场价格水平。

详细列出费用构成：在签订审计合同时，应详细列出费用的构成，包括基本收费、追加收费及其他额外费用，以避免后期出现纠纷。

通过以上方法，可以较为准确地确定工程审计的单价，确保审计工作的顺利进行和费用的合理控制。