财务工程审计是一个系统性的过程，涉及多个步骤和环节。以下是财务工程审计的一般流程和方法：

接受业务委托

审计人员在决定接受业务委托后，注册会计师应当与客户就审计约定条款达成一致意见。

计划审计工作

在执行具体审计程序之前，审计人员必须根据具体情况制定科学、合理的计划。

识别和评估重大错报风险

审计人员必须实施风险评估程序，以此作为评估财务报表层次和认定层次重大错报风险的基础。

应对重大错报风险

审计人员除了实施风险评估程序外，还应当实施进一步的审计程序。

编制审计报告

审计人员应当合理运用执业判断，形成适当的审计意见并出具相关的审计报告。

审计方法

全面审计法：按照国家或行业建筑工程预算定额的编制顺序或施工的先后顺序，逐一地对全部项目进行审查。其优点是全面、细致，经审计的工程造价差错比较少、质量比较高，缺点是工作量较大。适用于工程量小、工艺简单、造价编制或报价单位技术力量薄弱的单位。

标准图审计法：对于利用标准图纸或通过图纸施工的工程项目，先集中审计力量编制标准预算或决算造价，以此为标准，进行对比审计。适用于按标准图纸设计或通用图纸施工的工程，一般地面以上结构相同，可集中审计力量细审一份预决算造价，作为这种标准图纸的标准造价。

审计流程

填写审计资料交接清单并进行登记，进行审前调查。

制定审计方案，草拟审计通知书并签发。

对审计程序、质量、进度进行跟踪检查，核对工程项目。

登记工程核定单，留档留存。

复核工程审计工作底稿，编写工程结算审核情况报告。

编写财务审计工作底稿，审计结案。

审计内容

工程造价审计：对工程项目建设过程中的各项费用进行审计，确保资金的合理使用和工程造价的准确性。包括资料收集与审前调查、审计准备、审计实施、审计报告编制与提交、审计回访与跟踪等步骤。

竣工财务决算审计：将造价工程师审定的和未经造价工程师审核的所有支出加在一起，审查其是否有不合理支出，是否有挤占建设成本和计划外建设项目的现象，确定一个建设项目总的造价及工程管理过程是否合规合法。

法律依据

工程审计应依据国家的法令和财务制度、企业的经营方针、管理标准和规章制度，用科学的方法和程序进行审核检查，判断其是否合法、合理和有效。

通过以上步骤和方法，审计人员可以对财务工程进行全面、系统的审计，确保工程项目的合法性、合规性、经济性及效益性。