审计局审计工程程序通常遵循以下步骤：

资料收集与审前调查

接收施工单位送达的资料，并填写审计资料交接清单进行登记。

对施工单位的送审资料进行详细登记，包括项目名称、送达时间、联系人及电话、送审金额、初审情况等。

由审计组长进行审前调查，填写项目信息表，并制作审前调查报告或记录。

审计准备

主审制定审计方案，审计方案可以采取表格式或文本式。

主审负责草拟审计通知书，内容包括承诺书、提供资料清单、审计公示、廉洁反馈单等，并由分管局长签发。

审计实施

对组织审计的项目，工程主审需对审计程序、质量、进度进行跟踪检查。

外聘人员与施工单位核对前，需将初审情况告知工程主审，由工程主审与施工单位联系并在审计局指定地点进行核对。

工程量的复核需要工程部、审计部、主审与施工单位四方进行现场测量，并将测量结果形成书面勘察记录。

对审计异议问题，科室负责人召集审计组商议，并请分管领导参加，形成一致意见的均应形成业务会议纪要。

与建设、施工等相关单位沟通协调的，应形成协调会议纪要。

工程核定单经登记后，由审核人签字，建设、施工单位签字盖章后，送审计局，复核、批准、盖章后生效。建设、施工单位各执一份，主审留档两份，其余交科室专人留存。

工程审核明细一式三份，审计、建设、施工单位各执一份。

一般项目在接到报审之日起30天内完成，大型项目或有特殊情况的可适当延长审计期限，但应将延长理由告知被审计单位。

审计结案

主审对审计结果草拟审计报告征求意见稿，并将审计资料整理后一并送达科室负责人审核。

草拟的审计报告经分管局长审核后送达被审计单位征求意见，主审负责填写审计报告反馈意见说明书。

主审负责编写正式审计报告和审计决定，科室负责人负责填写审计报告审核意见书，递交法制部门复核。

主审负责审计结果文书的送达及审计决定执行事项，由主审将审计结果文书送达科室统计员进行统计和上报，并进行审计回访。

审计主审负责项目立档，装订前由档案专管员负责进行审核。

其他相关事项

审计机关根据审计项目计划确定的审计事项组成审计组，并应当在实施审计三日前，向被审计单位送达审计通知书。

审计人员通过审查会计凭证、会计账簿、会计报表，查阅与审计事项有关的文件、资料，检查现金、实物、有价证券，向有关单位和个人调查等方式进行审计，并取得证明材料。审计人员向有关单位和个人进行调查时，应当出示审计人员的工作证件和审计通知书副本。

这些步骤确保了审计过程的系统性、规范性和透明度，有助于保障审计结果的准确性和公正性。