医院资产评估的难点主要包括以下几个方面：

房屋基建工程改造装修计价问题

房屋建筑物是医院固定资产价值最大的一部分，具有占地面积广、使用范围大、使用期限长等特点。在对其进行资产评估时，如何准确计价房屋基建工程改造装修的费用是一个难点。这涉及到对房屋建筑物的新增、改建、扩建等项目的详细成本核算，包括材料费、人工费、设计费、施工费等。

资产管理人员配备问题

大部分医院在固定资产购置过程中，各项制度相对比较健全，程序比较规范。但购置以后，管理者对固定资产则不闻不问，不管经济效益，不问使用成本，有的资产闲置，有的损坏不维修。此外，资产管理人员配备要求不严，专职管理人员不多，大都兼任其他工作，人员流动性大，配备随意，专业人员少。负责二级明细账的会计人员，往往认为岗位不重要，人员业务素质要求低，大都配备“老弱病残”。

财务管理与资产管理不协调

固定资产管理是财务管理的重要组成部分，但部分医院财务管理人员包括领导从财务角度进行资产管理意识淡薄，重钱轻物。这导致财务管理与资产管理不协调，财务监督薄弱，无法有效进行资产的有效管理和评估。

重购置轻管理

目前，大部分医院在固定资产购置过程中，各项制度相对比较健全，程序比较规范。但购置以后，管理者对固定资产则不闻不问，不管经济效益，不问使用成本，有的资产闲置，有的损坏不维修。这种重购置轻管理的现象使得资产评估时无法准确评估资产的实际价值和使用效益。

综上所述，医院资产评估的难点主要集中在房屋基建工程改造装修计价、资产管理人员配备、财务管理与资产管理协调以及重购置轻管理等方面。为了提高医院资产评估的准确性和效率，需要从完善管理制度、加强资产管理人员培训、提高财务管理人员的管理意识等方面入手。