在南京进行整体资产评估，以下几家机构是不错的选择：

江苏华信资产评估有限公司

资质与业务范围：

华信评估为中国资产评估协会理事单位、江苏省资产评估协会副会长单位，具有证券期货相关业务的资产评估机构资格和军工涉密资质。提供各类资产评估，包括房地产评估、土地评估、工程造价、经济咨询服务等。

南京长城土地房地产资产评估造价咨询有限公司

资质与业务范围：

长城评估是集资产评估、土地估价、房地产估价、价格鉴证、工程造价、工程投资咨询等资质于一身的大型综合专业评估咨询审计机构，并下属设有会计师事务所、矿业权评估有限公司等。

江苏苏信房地产评估咨询有限公司

资质与业务范围：

苏信评估成立于1995年，是江苏省内较早从事不动产评估及土地规划业务的机构，业务遍及多个省份。专业团队涉及土地评估、房地产估价、咨询代理等。

南京信国资产评估有限公司

资质与业务范围：

信国评估提供各类有形资产评估、无形资产评估、企业价值评估、整体资产评估、单项资产评估等，并致力于评估、咨询的综合性服务。

江苏光大资产评估有限公司南京分公司

资质与业务范围：

光大评估南京分公司提供各类单项资产评估、企业整体资产评估及相关信息咨询服务。

这些机构在资产评估领域具有不同的专业优势和资质，可以根据具体需求和评估对象选择合适的机构进行合作。建议在选择时，进一步了解各机构的详细服务内容、客户评价和案例经验，以确保选择到最适合自己的合作伙伴。