南京大学本身是一所985和211高校，并不属于二本大学范畴。但根据您提供的信息，以下几所南京市的大学在二本批次招生：

南京工程学院

南京晓庄学院

三江学院

金陵科技学院

南京工业职业技术大学

江苏警官学院

南京航空航天大学金城学院

南京铁道职业技术学院

南京财经大学

南京审计大学

南京林业大学

河海大学

南京师范大学

解放军理工大学

南京邮电大学

南京医科大学

南京艺术学院

东南大学成贤学院

南京信息工程大学

南京中医药大学

南京体育学院

这些大学在江苏省内以及部分省份作为二本批次招生。需要注意的是，这些信息可能会随着每年的政策调整而发生变化，建议您在报考前查阅最新的招生简章或官方信息以获得最准确的录取信息。