土地资产评估的管理主要涉及以下部门：

自然资源部：

负责全国土地估价行业的监督管理。

省级自然资源主管部门：

负责本行政区域内土地估价行业的监督管理。

设区的市级自然资源主管部门：

按照省级自然资源主管部门确定的职责分工，履行本行政区域内的土地估价行业监督管理职责。

全国性土地估价行业协会：

负责实施全国土地估价行业的自律管理。

地方性土地估价行业协会：

接受全国性土地估价行业协会的业务指导，负责本行政区域内土地估价行业的自律管理。

此外，根据特定情况，如房地产评估公司归住建部门（住建局或者房管局等）管理，而土地评估公司归土地管理部门（现在就是自然资源和规划局）。

综上所述，土地资产评估的管理主要是由自然资源部及其下属的各级自然资源主管部门负责，同时，行业协会也承担一定的自律管理职责。