审计发现企业低估负债的方法主要包括：

检查应付账款

审查资产负债表日是否存在“货到单未到”的情况，即有材料入库凭证但未收到购货发票的经济业务。

检查资产负债表日后收到的购货发票，注意其日期，确认入账时间是否正确。

审查资产负债表日后应付账款明细账贷方发生额的相应凭证，确认入账时间是否正确。

函证程序

在进行函证时，通常不列明金额，而是让函证对方回函一个金额。审计人员将对方回函的金额与被审计单位的记录金额进行核对，以发现是否存在低估。

分析性程序

通过对比分析，比如将应付账款与营业收入、成本费用等进行配比分析，检查是否存在异常或不符合逻辑的情况。

检查相关凭证和文件

仔细审查与负债相关的所有凭证和文件，确保没有遗漏或错误记录。

询问和调查

向被审计单位的相关人员询问，了解负债确认的流程和依据。

对异常或可疑的交易进行进一步的调查。

关注隐藏凭证的行为

负债低估往往伴随着隐藏凭证，审计人员需要留意可能存在的隐秘交易或凭证。

通过上述方法，审计人员可以更有效地发现企业是否存在低估负债的情况。需要注意的是，审计过程中应保持专业怀疑，并遵循适当的审计程序