超市在进行资产清查时，可以采用以下方法：

成立清算组

由法院或超市股东会指定人员组成清算组，负责整个清算工作。清算组要接管超市的财产、印章、账簿等资料，对超市的财务状况进行全面清查。

清查资产负债

清算组要核实超市的所有资产，包括库存商品、固定资产、应收账款等，并准确统计负债，如应付账款、银行贷款、员工工资等。对资产进行评估和变现，固定资产可以通过拍卖等方式转化为现金，库存商品如果有价值也进行合理销售。

资产处置

根据评估结果，清算组对超市资产进行处置。例如，将库存商品低价出售，固定资产公开拍卖等。在处置过程中，要遵循相关法律规定，确保程序合法、公正、透明。

清理债权债务

一方面要通知债权人申报债权，对债权进行登记核实；另一方面要积极追讨超市的应收账款等债权。对于债务，需要用超市资产按法定顺序进行清偿，清偿顺序一般为：首先支付清算费用，其次支付职工工资、社会保险费用和法定补偿金，然后缴纳所欠税款，最后偿还普通债权。

实地盘点法

对固定资产进行实地清点盘查，确保固定资产核算的真实性、安全性和完整性。每年至少进行一次全面盘点。

技术推算法

利用技术方法对财物的实存数进行推算，适用于流动性较强的资产和库存商品等。

发函询证法

对往来款项进行清查，一般采用发函询证的方法进行核对，确保账目的准确性。

填制盘存清单

清查过程中，需要详细记录每项资产的名称、数量、价值等信息，并填制盘存清单，以便后续的账务处理和数据核对。

通过以上步骤和方法，可以全面、系统地对超市的资产进行清查和评估，确保资产处置的合法性和公正性，同时尽可能减少损失，为超市的清算工作提供准确的数据支持。