设立内部审计机构的方式主要有以下几种：

董事会领导

由董事会领导内部审计机构，这种设置方式具有较强的独立性，审计结果可以直接向董事会报告，有利于及时采取措施改善经营管理。

企业最高行政管理人员领导

内部审计机构由企业最高行政管理人员（如厂长、经理）领导，这种设置方式虽然有利于高级管理层及时采取措施，但审计的独立性可能会受到一定程度的制约。

企业最高财务主管领导

由企业最高财务主管（如总会计师）领导内部审计机构，这种方式会影响审计的独立性，不利于发挥内部审计的作用，因此较少采用。

分级管理方式

按照部门或单位的组织级次设置审计机构，一级组织对应一级审计机构。这种方式使内部审计人员熟悉各自单位的环境和情况，审计有较强的针对性和及时性，但独立性程度相对较差。

集中管理方式

只在部门或单位最高层次设置内部审计机构，下属基层不专门设置审计机构，由专门派出的审计人员对下属单位进行审计。这种方式下，派出人员对下属单位具有较高的权威，独立性程度较高，但需要加强审计的计划性。

监事会或审计委员会领导

由监事会或审计委员会领导内部审计机构，这种设置方式在法律、行政法规有明确规定的情况下较为常见，有助于保持内部审计的独立性和权威性。

总经理领导

内部审计机构隶属于总经理，这种方式有利于为经营决策服务，使内部审计机构与财会等部门相对独立，但不利于内审机构对总经理的责任和业绩进行独立评价和监督。

财务副总经理领导

由财务副总经理领导内部审计机构，这种方式在一些企业中也有采用，但相对较少见。

建议

选择合适的领导模式：根据企业的规模、结构和治理需求，选择最适合的领导模式。大型企业或需要较高独立性的企业，建议采用董事会或监事会领导的模式。中小企业或需要快速响应的企业，可以考虑总经理或财务副总经理领导的模式。

平衡独立性与灵活性：无论选择哪种领导模式，都应确保内部审计机构具有一定的独立性，同时也要保持灵活性，以便更好地为企业的经营管理服务。

考虑法规要求：根据相关法律法规的要求，设立内部审计机构，并确保其独立性和权威性。

通过以上方式，企业可以设立一个高效、独立的内部审计机构，为企业的健康运营和持续发展提供有力保障。